
Las primeras películas de Waters presentaban carácteres asquerosamente amables en situaciones vergonzosas con un diálogo hiperbólico. Pink Flamingos, Female Trouble y Desperate Living, fueron catalogadas por él mismo como una "trilogía de basura", éstas últimas además fueron, por aquella época, muy cuestionadas y hasta en algunos casos censuradas. Un segmento particularmente notorio fue el final de Pink Flamingos, en donde se muestra a Divine comiendo excremento de perro.
Con el tiempo sus trabajos fueron menos polémicos y más "mainstream", aunque películas como Hairspray, Cry-Baby y Serial Mom conservan inevitablemente su inventiva marca registrada. Quizás en su más reciente obra A dirty shame intentó volver a su controvertida tarea pero, indudablemente los tiempos cambiaron y su arte también.
En 1997 participo en la famosa serie Los Simpson, prestando su voz al personaje gay John en el episodio Homer's Phobia.

Hag in a Black Leather Jacket (1964)
Roman Candles (1966)
Eat Your Makeup (1968)
Mondo Trasho (1969)
The Diane Linkletter Story (1969)
Multiple Maniacs (1970)
Pink Flamingos (1972)
Female Trouble (1974)
Desperate Living (1977)
Polyester (1981)
Hairspray 1988
Divine (1990)
Cry-Baby (1990)
Serial Mom (1994)
Pecker (1999)
A morte Hollywood (2000)
A Dirty Shame (2004)